Les orgues lombards (ou piémontais à Fontan) que l’on trouve dans les cinq églises de la vallée de la Roya, ont été construits ou remis en forme pour ces églises au XIXe siècle. Ceux de Fontan et Breil, du XVIIIe siècle, sont des réemplois plus ou moins reconditionnés. L’ensemble constitue un patrimoine mobilier et artistique d’une grande richesse. Ils ont été restaurés pendant les années 1970 – 1980 sous l’impulsion des organistes Sant et Saorgin. Avec les autres orgues de la route royale savoyarde, de la Bevera et de la Vermenagna, ils accueillent un festival international d’orgues chaque été.
La commande de l’orgue de la collégiale Saint-Martin fut passée aux frères Lingiardi, facteurs d’orgues à Pavie, en 1847, et livrée en 1849.
Le buffet et la tribune furent réalisés par l’ébéniste Giovanni Battista Tosello de Limone, vivant à La Brigue, selon les dessins du buffet de Luigi Lingiardi.
Les décors des panneaux du garde-corps de la tribune, de style baroque en bois sculpté, peint et doré, représentent des instruments de musique.
Le buffet est encadré par deux colonnes à chapiteaux composites soutenant une corniche en anse de panier souligné par un « rideau de théâtre » en bois peint. Dechaque côté, des balcons à garde-corps grillagés dissimulent la grosse caisse et ses accessoires. Les cinq soufflets d’origine se trouvent dans les coffres latéraux.
Malheureusement, en 1925 et surtout en 1957, cet orgue a subi de profondes transformations, qui lui firent perdre son caractère italien.
Une restauration par Yves Cabourdin, en 1987, a heureusement permis de retrouver le style caractéristique d’origine, en s’appuyant sur les documents originaux et sur l’analyse d’instruments contemporains des Lingiardi.
Le clavier, qui n’est pas d’origine, est à octave courte ; le pédalier « a leggio » a une extension réelle des 12 notes chromatiques. Quant à la disposition phonique, elle comporte un ripieno très développé, et une grande quantité de jeux de concert.
L’instrument de la Brigue est le plus grand de la vallée de la Roya.